有学者认为，冗长的内部会议会浪费大量时间，长会（超过60分钟到90分钟）通常没有成效
对国内企业来说，加班没有等值回报也是员工厌恶加班的重要原因。有评论者指出，“996工作制”在很多知名互联网企业中早已实行，58同城的员工却如此愤怒的一个原因就是，该公司的薪资待遇并不突出，而零补贴的长时间加班意味着变相降薪，这样的加班自然不受欢迎。
此外，还有员工和分析人士认为，58同城此时推出“996工作制”是变相进行人员清理，不能接受的员工会自动离职。这样既能清理队伍冗员，又不需要付出直接裁员那样的补贴。果真如此，加班不仅没有回报，还会有利益损失，员工的强力反弹在意料之中。
员工长期加班，企业效益不一定好，还会有意想不到的弊端
企业希望员工加班，主要是为了降低企业用人成本，增加企业产出，但效果如何，国内仍缺乏权威研究。不过从国外的一些研究看来，员工长期加班，企业不一定得到太多的好处。斯坦福大学的一项研究，员工一周工作50小时以上，企业生产率将大幅下滑，超过55小时生产率将几乎锐降至零，因此多出的15小时几乎没有任何意义。
这份调查的作者约翰·潘卡韦尔表示，这可能是因为“长时间工作的员工可能会感到疲惫或压力，这不仅会降低他们的生产率，还会增加失误、事故和疾病的几率，给雇主带来损失。”
在日本中京财经研究所的研究报告中，超过70%的受调查企业承认，因加班而导致疲劳工作、效率下降的代价已超越额外工作带来的收益。2009年，日本《钻石周刊》尖锐地指出，“过度加班是一种不健康的经济现象”，“加班不是日本崛起的根源，相反，它是日本在过去20年里走向衰退的原因之一”。
在日本的末班地铁上，随便躺下睡觉的职员并不少见
企业过度加班，对社会还有些意想不到的危害。在日本有分析人士认为，加班导致很多女性被排除出劳动大军，因为工作时间过长让女性无法平衡家庭和事业，“新妈妈”往往被迫辞去工作，要不就打定主意不要孩子；同时，父亲因为工作时间长，会在家庭教育中缺席。因此，日本政府在“少子化”对策中提出，更要改变“工作方式”，争取让有6岁以下孩子的男性有更多时间回归家庭。
“加班文化”导致企业效率低下，则直接影响企业的海外竞争力。即使企业走出去，也常会水土不服。2012年，国内媒体曾报道，巴西圣保罗州负责外贸事务的官员曾在当地报纸撰文指出，中资企业的巴西籍管理人员因“经常加班、凌晨开会”而抱怨不休。有统计表明，42%的巴西籍管理人员在中资企业内干不到1年就辞职走人。
遏制加班，需要法律介入，还需要企业主动转身
按照“996”工作制的要求，朝9晚9，每周工作6天，即使休息2个小时，每天工作也有10小时，6天就是60小时。这样的工作时间安排，不少劳动法专家认为，这已经明显违反了我国劳动法的相关规定，员工可以向劳动监察部门举报、投诉，由劳动监察部门介入调查、处理。
